20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3588 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  100 
 
 		 253 aa  495  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  40.57 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  39.09 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  36.73 
 
 		 238 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  35.06 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  35.68 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  35.68 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  35.68 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  33.94 
 
 		 294 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  33.2 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  32.28 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  28.15 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  30.63 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  30.09 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  32.43 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  37.7 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  22.64 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  27.93 
 
 		 246 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  29.79 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  38.57 
 
 		 234 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>