37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2462 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  68.03 
 
 		 294 aa  323  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  37.89 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  37.89 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  37.89 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  36.25 
 
 		 237 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  37.15 
 
 		 238 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  34.78 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  30.53 
 
 		 476 aa  88.2  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  35.97 
 
 		 232 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  33.99 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  34.51 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  29.64 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  37.17 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  29.03 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  27.78 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  36.14 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  37.5 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  27.31 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  31.18 
 
 		 210 aa  57  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  26.06 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  27.02 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  39 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  23.43 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  37.01 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  36.36 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  29.17 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0625  Anti-sigma K factor RskA  32.17 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.793553 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  28.35 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  45.45 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  35.29 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0472  hypothetical protein  32.8 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  27.61 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  41.27 
 
 		 220 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  27.81 
 
 		 277 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  33.01 
 
 		 244 aa  42.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>