33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5092 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  511  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  33.98 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  32.08 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  33.21 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  30.2 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  31.01 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  28.35 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  28.63 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  39.6 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  32.18 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  30.71 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  25.49 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.68 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  26.41 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  48 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  35.34 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  28.24 
 
 		 294 aa  45.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  30.32 
 
 		 318 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  41.1 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  41.58 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  29.89 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  31.25 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  28.74 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  40.98 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0231  Fe-S oxidoreductase  46.94 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  30.49 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  23.53 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  28.36 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  44.07 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  39.29 
 
 		 239 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  39.29 
 
 		 239 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  39.29 
 
 		 239 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>