40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3291 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  42.52 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  40.4 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  40.48 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  37.3 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  38.87 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  35.84 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  31.44 
 
 		 259 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  33.21 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  33.2 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  31.2 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  38.37 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  32.94 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  32.94 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  32.94 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  33.2 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  28.74 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  37.74 
 
 		 476 aa  65.9  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  29.15 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  38.46 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  31.05 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  35.19 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  32.31 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  31.23 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  22.71 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  25.97 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1574  putative transmembrane anti-sigma factor  23.79 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  29.39 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2432  hypothetical protein  30.91 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  25.46 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  36.94 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  25.13 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.58 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  41.33 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  32.43 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  27.89 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  31.51 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4651  putative transmembrane anti-sigma factor  34.48 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.202977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0155  putative transmembrane anti-sigma factor  35.29 
 
 		 203 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000067167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  31.48 
 
 		 291 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>