57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4263 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  492  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  78.05 
 
 		 246 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  40.87 
 
 		 248 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  41.32 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  37.5 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  37.3 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  30.04 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  35.25 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  30.23 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  30.23 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  30.56 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  30.56 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  30.56 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  30.28 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  45.74 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  35.71 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  29.17 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  27.96 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  32.35 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  28.81 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  29.71 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  25.68 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  26.44 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  29.41 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  29.8 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  25 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  29.41 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  39.25 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  48.08 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  26.89 
 
 		 313 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  30.25 
 
 		 363 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3193  putative transmembrane anti-sigma factor  42.03 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4651  putative transmembrane anti-sigma factor  27.76 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.202977  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  28.51 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  23.41 
 
 		 318 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  55.56 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  28.17 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  40.91 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0131  putative transmembrane anti-sigma factor  36.84 
 
 		 347 aa  46.2  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000144677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0937  putative transmembrane anti-sigma factor  28.45 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  30.09 
 
 		 253 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  23.23 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  44.23 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  27.27 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  47.5 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  39.73 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  48.89 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1703  putative transmembrane anti-sigma factor  32.31 
 
 		 75 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.864451  hitchhiker  0.000407329 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  55 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  25.33 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2017  hypothetical protein  29.08 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1186  putative transmembrane anti-sigma factor  32.77 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.254511  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  23.17 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  28.92 
 
 		 277 aa  42.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  26.34 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  23.37 
 
 		 274 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  26.75 
 
 		 227 aa  42  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>