28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  470  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  31.36 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  35.95 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  29.46 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  30.92 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  32.51 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  38.83 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  32.31 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  29.87 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  29.87 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  29.87 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  28.68 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  27.73 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  30.25 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  28.33 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  23.39 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  28.36 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  29.63 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  30.74 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  29.44 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  27.24 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  27.46 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  25 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  32.22 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  31.25 
 
 		 476 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  20.41 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  31.08 
 
 		 233 aa  42  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>