24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1598 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  504  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  23.97 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  30.16 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  29.5 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  26.12 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  29.96 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  38.46 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  28.47 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4651  putative transmembrane anti-sigma factor  25.91 
 
 
263 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.202977  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  30.86 
 
 
210 aa  52.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1110  hypothetical protein  29.46 
 
 
211 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  29.72 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  28.72 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  42.11 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  26.64 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  33.85 
 
 
277 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  36.11 
 
 
476 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  27.52 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  32.47 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  26.64 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  24.62 
 
 
264 aa  42.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  35.37 
 
 
287 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  23.13 
 
 
276 aa  42.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  36.21 
 
 
262 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>