34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3072 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  36.21 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  34.77 
 
 		 276 aa  172  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  32.4 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  28.94 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  29.62 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  27.8 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  28.32 
 
 		 264 aa  99.8  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  24.12 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  28.1 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  25.87 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  24.51 
 
 		 240 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  27.48 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  22.71 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3578  hypothetical protein  26.85 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  27.24 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  24.34 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  25.17 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0899  hypothetical protein  32 
 
 		 155 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  26.87 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4651  putative transmembrane anti-sigma factor  25.28 
 
 		 263 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.202977  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1665  hypothetical protein  26.4 
 
 		 142 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6618  hypothetical protein  37.8 
 
 		 169 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3520  hypothetical protein  33.82 
 
 		 172 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0900  hypothetical protein  31.94 
 
 		 159 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1574  putative transmembrane anti-sigma factor  20.68 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  22.39 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1970  hypothetical protein  29.17 
 
 		 137 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0162497  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  25.97 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  24.71 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  21.88 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  24.82 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  22.78 
 
 		 210 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  35.16 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>