17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0894 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 214 aa  428  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1110  hypothetical protein  48.13 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  32.66 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0937  putative transmembrane anti-sigma factor  33.01 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0625  Anti-sigma K factor RskA  36.89 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.793553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  30.22 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  24.49 
 
 		 264 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  23.68 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  31.91 
 
 		 315 aa  45.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  23.16 
 
 		 294 aa  45.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  27.83 
 
 		 243 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  27.83 
 
 		 243 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  27.83 
 
 		 243 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  22.84 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1709  putative transmembrane anti-sigma factor  42.86 
 
 		 104 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0156325  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  31.34 
 
 		 313 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  27.74 
 
 		 390 aa  41.2  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>