24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4472 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  607  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  35.69 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  36.33 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  33.44 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  30.2 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  28.24 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  30.36 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  28.52 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0899  hypothetical protein  37.84 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  21.72 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1970  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0162497  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0900  hypothetical protein  36.76 
 
 		 159 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  26.06 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  38.03 
 
 		 240 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1665  hypothetical protein  25.87 
 
 		 142 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  34.62 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3520  hypothetical protein  24.18 
 
 		 172 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  29.66 
 
 		 210 aa  46.2  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  36.36 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  38.18 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  38.18 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  36.99 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0625  Anti-sigma K factor RskA  37.88 
 
 		 206 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.793553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3578  hypothetical protein  30.11 
 
 		 264 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>