38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3788 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3788  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 235 aa  463  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3509  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 		 272 aa  168  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160766 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  41.77 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  31.58 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  31.3 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1186  putative transmembrane anti-sigma factor  30.59 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.254511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  48.75 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  30.8 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  26.52 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  28.15 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  28.63 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  28.63 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  28.63 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  26.03 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  49.12 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  41.89 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  46.3 
 
 		 277 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  45.1 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  43.33 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  26.87 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  32.35 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2151  putative transmembrane anti-sigma factor  30.91 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  37.9 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8247  putative transmembrane anti-sigma factor  23.89 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  43.18 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  51.28 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3713  putative transmembrane anti-sigma factor  55.26 
 
 		 62 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.181585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  42.59 
 
 		 363 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1994  putative transmembrane anti-sigma factor  41.51 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000192498  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  26.05 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  20.55 
 
 		 393 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0580  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.83 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  41.67 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  48.72 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  43.75 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  46.15 
 
 		 250 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  36.07 
 
 		 259 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0405  hypothetical protein  39.29 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0999853  normal  0.062689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>