23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3509 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3509  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
272 aa  525  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3788  putative transmembrane anti-sigma factor  62.14 
 
 
235 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  37.09 
 
 
244 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  52.94 
 
 
223 aa  56.6  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  50.88 
 
 
247 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  44.74 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  30 
 
 
270 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  42.86 
 
 
259 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  53.85 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  46 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  46 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  49.02 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  46.67 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  44.19 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  46 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  47.83 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  47.06 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1994  putative transmembrane anti-sigma factor  38.24 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000192498  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 
234 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  47.62 
 
 
292 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  58.33 
 
 
220 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  46.51 
 
 
273 aa  42.7  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  40.82 
 
 
242 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>