22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5018 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
234 aa  471  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  76.62 
 
 
238 aa  301  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  57.14 
 
 
239 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  56.71 
 
 
239 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  56.71 
 
 
239 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  37.29 
 
 
250 aa  132  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  33.07 
 
 
259 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  32.6 
 
 
239 aa  88.6  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  32.5 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  29.88 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  35.24 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  55.93 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  56.6 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  32.11 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  40.58 
 
 
277 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  34.04 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  31.87 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1186  putative transmembrane anti-sigma factor  24.77 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.254511  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  30.11 
 
 
259 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8247  putative transmembrane anti-sigma factor  29.77 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  23.95 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3713  putative transmembrane anti-sigma factor  55.88 
 
 
62 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.181585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>