26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0246 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  32.95 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  35 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  29.89 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  31.37 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  31.37 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  67.21 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  66.67 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  58.62 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  67.92 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  59.62 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  57.14 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  29.41 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  56.36 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  53.19 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3509  putative transmembrane anti-sigma factor  30.71 
 
 
272 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  51.02 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  31 
 
 
270 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  41.18 
 
 
258 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8247  putative transmembrane anti-sigma factor  27.45 
 
 
235 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3788  putative transmembrane anti-sigma factor  58.82 
 
 
235 aa  45.4  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  44.23 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  46.81 
 
 
371 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  62.5 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  59.38 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08330  hypothetical protein  42.59 
 
 
263 aa  42.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0824478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>