20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1084 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 247 aa  481  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  35.97 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  33.73 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  34.44 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  34.44 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  34.44 
 
 		 239 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  32.35 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  33.73 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  31.38 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  29.55 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8247  putative transmembrane anti-sigma factor  26.15 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  54.17 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  56.36 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  29.7 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  53.7 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  52.5 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3713  putative transmembrane anti-sigma factor  56.76 
 
 		 62 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.181585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  47.62 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1186  putative transmembrane anti-sigma factor  27.88 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.254511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>