13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3942 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3942  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 221 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.248924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0405  hypothetical protein  47.23 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0999853  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  30.57 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  29.31 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  41.46 
 
 		 258 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  32.14 
 
 		 259 aa  48.9  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  31.12 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  30.64 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  26.85 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  26.85 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  27.75 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  26.39 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4203  hypothetical protein  35.63 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.376923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>