20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1326 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1326  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  891    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000243968  hitchhiker  0.00621187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  36.81 
 
 		 371 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1269  hypothetical protein  36.89 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000022202  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  29.34 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4156  putative transmembrane anti-sigma factor  32.89 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0909715  hitchhiker  0.000583924 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  29.52 
 
 		 329 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  38.67 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  27.27 
 
 		 336 aa  55.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1893  putative transmembrane anti-sigma factor  30.43 
 
 		 212 aa  53.5  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0781  putative transmembrane anti-sigma factor  38.18 
 
 		 80 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  37.21 
 
 		 393 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  30.7 
 
 		 360 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0765  hypothetical protein  45.24 
 
 		 206 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000236872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0858  hypothetical protein  29.63 
 
 		 110 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.60587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0334  putative transmembrane anti-sigma factor  47.37 
 
 		 79 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0219633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1602  hypothetical protein  43.33 
 
 		 202 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1028  putative transmembrane transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3276  putative transmembrane anti-sigma factor  36.07 
 
 		 80 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.953611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5442  putative transmembrane anti-sigma factor  44.74 
 
 		 368 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0144  putative transmembrane anti-sigma factor  30.16 
 
 		 152 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>