28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1580 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 271 aa  534  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  99.63 
 
 		 271 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  95.57 
 
 		 271 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  65.94 
 
 		 276 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5341  putative transmembrane anti-sigma factor  31.35 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  25.88 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  26.14 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  25.67 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  24.91 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  29.14 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  25.87 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  25.99 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  26.28 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  27.33 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  27.59 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  27.17 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  25.86 
 
 		 146 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  31.19 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  25.27 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2633  putative transmembrane anti-sigma factor  35.14 
 
 		 169 aa  45.4  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4156  putative transmembrane anti-sigma factor  32.2 
 
 		 366 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0909715  hitchhiker  0.000583924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.08 
 
 		 376 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  28.71 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  47.62 
 
 		 91 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  30 
 
 		 336 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  23.94 
 
 		 266 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  35.71 
 
 		 371 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2588  hypothetical protein  37.7 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>