16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0131 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0131  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 347 aa  706    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000144677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.55 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4156  putative transmembrane anti-sigma factor  26.82 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0909715  hitchhiker  0.000583924 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2126  putative transmembrane anti-sigma factor  29.62 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  31.71 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2249  putative transmembrane anti-sigma factor  27.61 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  26.34 
 
 		 360 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3851  putative anti-sigma factor  24.03 
 
 		 221 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  26.98 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0088  putative transmembrane anti-sigma factor  26.8 
 
 		 316 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  38.46 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  25.15 
 
 		 276 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0580  anti-ECFsigma factor, ChrR  43.59 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1703  putative transmembrane anti-sigma factor  29.17 
 
 		 75 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.864451  hitchhiker  0.000407329 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  36.78 
 
 		 266 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0804  hypothetical protein  32.61 
 
 		 188 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>