21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0804 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0804  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  386  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2732  hypothetical protein  28.86 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0155  putative transmembrane anti-sigma factor  28.97 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000067167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0151  putative transmembrane anti-sigma factor  29.63 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  22.67 
 
 		 266 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  32.5 
 
 		 390 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2266  hypothetical protein  22.77 
 
 		 177 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0462118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  22.31 
 
 		 363 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2177  hypothetical protein  22.77 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0913257  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0580  anti-ECFsigma factor, ChrR  20.35 
 
 		 267 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  18.52 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  26.89 
 
 		 360 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  23.94 
 
 		 376 aa  42.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0131  putative transmembrane anti-sigma factor  32.61 
 
 		 347 aa  42.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000144677  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0245  putative transmembrane anti-sigma factor  23.73 
 
 		 237 aa  42  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1269  hypothetical protein  31.58 
 
 		 331 aa  42  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000022202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3851  putative anti-sigma factor  20.35 
 
 		 221 aa  41.6  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1326  hypothetical protein  29.73 
 
 		 465 aa  41.6  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000243968  hitchhiker  0.00621187 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  21.33 
 
 		 300 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2249  putative transmembrane anti-sigma factor  32.61 
 
 		 412 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  26.87 
 
 		 266 aa  41.2  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>