23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2018 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 384 aa  778    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2125  putative transmembrane anti-sigma factor  31.11 
 
 		 175 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.266191  normal  0.0344779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  37.1 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  28.57 
 
 		 146 aa  50.4  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4147  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.15 
 
 		 152 aa  49.7  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  28.33 
 
 		 329 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2732  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  27.37 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  30 
 
 		 336 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  38.46 
 
 		 91 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0131  putative transmembrane anti-sigma factor  34.62 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000144677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4156  putative transmembrane anti-sigma factor  26.89 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0909715  hitchhiker  0.000583924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.58 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  34.43 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1893  putative transmembrane anti-sigma factor  30.95 
 
 		 212 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2076  putative transmembrane anti-sigma factor  23.89 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000018802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  27.2 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0273  putative transmembrane anti-sigma factor  29.21 
 
 		 135 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287292  normal  0.724459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4633  putative transmembrane anti-sigma factor  37.93 
 
 		 279 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5341  putative transmembrane anti-sigma factor  27.47 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  33.85 
 
 		 81 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  34.25 
 
 		 192 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  30.56 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>