11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0764 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0764  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 88 aa  177  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0867  putative transmembrane anti-sigma factor  72.86 
 
 		 77 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.71952  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2153  hypothetical protein  60.24 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0624  hypothetical protein  57.83 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0758  putative transmembrane anti-sigma factor  57.33 
 
 		 78 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1703  putative transmembrane anti-sigma factor  57.14 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.864451  hitchhiker  0.000407329 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1890  hypothetical protein  45.71 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2126  putative transmembrane anti-sigma factor  38.46 
 
 		 356 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5341  putative transmembrane anti-sigma factor  32.31 
 
 		 268 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  32.47 
 
 		 376 aa  42  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  30.67 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>