16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0867 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0867  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 77 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.71952  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0764  putative transmembrane anti-sigma factor  72.86 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0624  hypothetical protein  60.81 
 
 		 85 aa  90.1  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2153  hypothetical protein  58.67 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0758  putative transmembrane anti-sigma factor  61.43 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1703  putative transmembrane anti-sigma factor  54.29 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.864451  hitchhiker  0.000407329 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1890  hypothetical protein  42.86 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0600  hypothetical protein  34.33 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2126  putative transmembrane anti-sigma factor  36.54 
 
 		 356 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  38.46 
 
 		 363 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  30.43 
 
 		 322 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.34 
 
 		 253 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  32.05 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0151  putative transmembrane anti-sigma factor  34.78 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  28.99 
 
 		 376 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>