24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0600 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0600  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  194  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5547  hypothetical protein  34.33 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  36.62 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3828  hypothetical protein  33.33 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.729319  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  32.88 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3700  anti-sigma factor  35.38 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1380  hypothetical protein  30.34 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0867  putative transmembrane anti-sigma factor  34.33 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.71952  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1398  hypothetical protein  30.34 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0698025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3524  anti-sigma factor  34.72 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4688  hypothetical protein  27.66 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0317438  normal  0.0385147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1414  hypothetical protein  31.71 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  30.77 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30740  anti-sigma factor, TIGR02949 family  29.33 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1779  hypothetical protein  31.94 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1917  anti-sigma factor  33.85 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8323  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0624  hypothetical protein  33.85 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0549  anti-sigma factor  32.79 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0539  anti-sigma factor  28.17 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1108  anti-sigma factor  32.31 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.400545  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13248  anti-sigma factor  32.76 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.434882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4094  anti-sigma factor RshA  26.76 
 
 		 95 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91245  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3713  hypothetical protein  26.76 
 
 		 95 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>