37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1414 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1414  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1380  hypothetical protein  98.97 
 
 
97 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1398  hypothetical protein  98.97 
 
 
97 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0698025  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4688  hypothetical protein  82.98 
 
 
109 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0317438  normal  0.0385147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1779  hypothetical protein  80 
 
 
110 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3524  anti-sigma factor  57.83 
 
 
103 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13248  anti-sigma factor  72.73 
 
 
101 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.434882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1108  anti-sigma factor  49.37 
 
 
93 aa  90.1  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.400545  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30740  anti-sigma factor, TIGR02949 family  50.65 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992034  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4094  anti-sigma factor RshA  46.99 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91245  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3713  hypothetical protein  46.99 
 
 
95 aa  84  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6291  anti-sigma factor  50 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1409  anti-sigma factor  42.53 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.575969  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0962  anti-sigma factor RshA  45.57 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189444  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3767  anti-sigma factor  44.44 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.544196  normal  0.304611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5188  anti-sigma factor  37.5 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167688  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4189  anti-sigma factor  35.14 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0549  anti-sigma factor  36.96 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0539  anti-sigma factor  39.74 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  39.19 
 
 
88 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  40.79 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3700  anti-sigma factor  36.11 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1809  anti-sigma factor  30 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.847079  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8323  hypothetical protein  38.27 
 
 
88 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1917  anti-sigma factor  38.67 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1213  Anti-sigma factor RshA  33.73 
 
 
90 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09500  anti-sigma factor, TIGR02949 family  37.14 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.394687  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2491  anti-sigma factor  33.78 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1266  anti-sigma factor  35.21 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293532  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7736  anti-sigma factor  31.17 
 
 
93 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0600  hypothetical protein  31.71 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1707  anti-sigma factor  30 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.106573  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  32.91 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0755  anti-sigma factor  30.67 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07710  anti-sigma factor, TIGR02949 family  37.33 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0583122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2383  anti-sigma factor  34.48 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000453147 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19440  anti-sigma factor, TIGR02949 family  30.3 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>