13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5547 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5547  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  161  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3828  hypothetical protein  44.62 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.729319  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0600  hypothetical protein  34.33 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5188  anti-sigma factor  31.58 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167688  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  35.82 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3767  anti-sigma factor  31.51 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.544196  normal  0.304611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0962  anti-sigma factor RshA  30.14 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189444  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0539  anti-sigma factor  32.88 
 
 		 90 aa  42.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3713  hypothetical protein  31.51 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30740  anti-sigma factor, TIGR02949 family  32.84 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8323  hypothetical protein  32 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6291  anti-sigma factor  30.14 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4094  anti-sigma factor RshA  30.14 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91245  normal  0.0630155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>