36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5188 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5188  anti-sigma factor  100 
 
 		 87 aa  177  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167688  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4094  anti-sigma factor RshA  65.85 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91245  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3713  hypothetical protein  65.85 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6291  anti-sigma factor  56.96 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3767  anti-sigma factor  51.9 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.544196  normal  0.304611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0962  anti-sigma factor RshA  52.5 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189444  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0539  anti-sigma factor  55.56 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0549  anti-sigma factor  48.15 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  42.68 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8323  hypothetical protein  43.9 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7736  anti-sigma factor  41.76 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4189  anti-sigma factor  45.45 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3524  anti-sigma factor  42.47 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1409  anti-sigma factor  41.25 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.575969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  37.8 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4688  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0317438  normal  0.0385147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1108  anti-sigma factor  42.47 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.400545  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1779  hypothetical protein  38.75 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30740  anti-sigma factor, TIGR02949 family  39.73 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1380  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1414  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1398  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0698025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3700  anti-sigma factor  34.62 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09500  anti-sigma factor, TIGR02949 family  36 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.394687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2491  anti-sigma factor  39.29 
 
 		 88 aa  57  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13248  anti-sigma factor  39.34 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.434882 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1809  anti-sigma factor  31.51 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.847079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1266  anti-sigma factor  40.58 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293532  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  37.97 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1917  anti-sigma factor  36 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  38.46 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1707  anti-sigma factor  32.39 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.106573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0755  anti-sigma factor  37.5 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5547  hypothetical protein  31.58 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07710  anti-sigma factor, TIGR02949 family  28.74 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0583122  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1213  Anti-sigma factor RshA  28.95 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>