39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4094 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4094  anti-sigma factor RshA  100 
 
 		 95 aa  189  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91245  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3713  hypothetical protein  94.74 
 
 		 95 aa  181  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5188  anti-sigma factor  65.85 
 
 		 87 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167688  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6291  anti-sigma factor  55.43 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0962  anti-sigma factor RshA  59.49 
 
 		 94 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189444  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3767  anti-sigma factor  60.76 
 
 		 94 aa  100  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.544196  normal  0.304611 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0539  anti-sigma factor  53.57 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  53.66 
 
 		 99 aa  87  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1398  hypothetical protein  46.99 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0698025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0549  anti-sigma factor  54.32 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1380  hypothetical protein  46.99 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1414  hypothetical protein  46.99 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8323  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1409  anti-sigma factor  47.62 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.575969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7736  anti-sigma factor  44.09 
 
 		 93 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1779  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  46.43 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4688  hypothetical protein  40.74 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0317438  normal  0.0385147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3524  anti-sigma factor  45.78 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30740  anti-sigma factor, TIGR02949 family  43.9 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3700  anti-sigma factor  46.75 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1108  anti-sigma factor  45.45 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.400545  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4189  anti-sigma factor  44.44 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1707  anti-sigma factor  40 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.106573  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1917  anti-sigma factor  35.56 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  42.03 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13248  anti-sigma factor  45.76 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.434882 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1809  anti-sigma factor  32.88 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.847079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  41.67 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09500  anti-sigma factor, TIGR02949 family  38.89 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.394687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0755  anti-sigma factor  38.36 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2491  anti-sigma factor  36.36 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1266  anti-sigma factor  39.13 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293532  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1213  Anti-sigma factor RshA  32.18 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07710  anti-sigma factor, TIGR02949 family  31.33 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0583122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2383  anti-sigma factor  33.8 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000453147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3851  putative anti-sigma factor  35.62 
 
 		 221 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5547  hypothetical protein  30.14 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0600  hypothetical protein  26.76 
 
 		 95 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>