40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0962 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0962  anti-sigma factor RshA  100 
 
 		 94 aa  193  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189444  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3767  anti-sigma factor  85.11 
 
 		 94 aa  165  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.544196  normal  0.304611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3713  hypothetical protein  60.76 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4094  anti-sigma factor RshA  59.49 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91245  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0539  anti-sigma factor  53.57 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8323  hypothetical protein  52.38 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6291  anti-sigma factor  48.31 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5188  anti-sigma factor  52.5 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167688  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  50.63 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  43.18 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0549  anti-sigma factor  47.83 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1409  anti-sigma factor  44.68 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.575969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7736  anti-sigma factor  46.99 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1108  anti-sigma factor  43.59 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.400545  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1779  hypothetical protein  50.75 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1414  hypothetical protein  45.57 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1398  hypothetical protein  45.57 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0698025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1380  hypothetical protein  45.57 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3700  anti-sigma factor  45.74 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4189  anti-sigma factor  41.86 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4688  hypothetical protein  46.27 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0317438  normal  0.0385147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30740  anti-sigma factor, TIGR02949 family  37.78 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3524  anti-sigma factor  39.73 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1917  anti-sigma factor  39.71 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1707  anti-sigma factor  38.1 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.106573  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2491  anti-sigma factor  38.64 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13248  anti-sigma factor  39.68 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.434882 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  33.78 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1809  anti-sigma factor  33.78 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.847079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1213  Anti-sigma factor RshA  35.37 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09500  anti-sigma factor, TIGR02949 family  36 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.394687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  38.36 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2383  anti-sigma factor  36.36 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000453147 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1266  anti-sigma factor  35.14 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293532  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2650  hypothetical protein  36.36 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5547  hypothetical protein  30.14 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0755  anti-sigma factor  33.8 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07710  anti-sigma factor, TIGR02949 family  30.49 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0583122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4156  putative transmembrane anti-sigma factor  28.57 
 
 		 366 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0909715  hitchhiker  0.000583924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2153  hypothetical protein  29.41 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>