11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2153 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2153  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0624  hypothetical protein  58.82 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0764  putative transmembrane anti-sigma factor  60.24 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0867  putative transmembrane anti-sigma factor  58.67 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.71952  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0758  putative transmembrane anti-sigma factor  59.15 
 
 		 78 aa  86.7  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1890  hypothetical protein  51.39 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1703  putative transmembrane anti-sigma factor  54.29 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.864451  hitchhiker  0.000407329 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2126  putative transmembrane anti-sigma factor  36.36 
 
 		 356 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  32.05 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  33.82 
 
 		 322 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0962  anti-sigma factor RshA  29.41 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189444  normal  0.166118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>