38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3810 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  165  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  41.1 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0795  hypothetical protein  34.21 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.753726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2572  hypothetical protein  35.71 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0333  putative transmembrane anti-sigma factor  38.1 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  42.55 
 
 		 336 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0781  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  43.33 
 
 		 376 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  46.15 
 
 		 329 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2153  hypothetical protein  32.05 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  29.49 
 
 		 384 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  34.92 
 
 		 393 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0049  hypothetical protein  31.43 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2249  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 		 412 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  43.08 
 
 		 371 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3940  putative transmembrane anti-sigma factor  47.22 
 
 		 292 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000279059  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2126  putative transmembrane anti-sigma factor  51.22 
 
 		 356 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2792  hypothetical protein  41.18 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0794  sigma-24 (FecI-like)  37.93 
 
 		 285 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2794  hypothetical protein  41.3 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0842  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.93 
 
 		 288 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0131  putative transmembrane anti-sigma factor  29.33 
 
 		 347 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000144677  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0846  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.93 
 
 		 292 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0839  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40.74 
 
 		 283 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  36.51 
 
 		 271 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0867  putative transmembrane anti-sigma factor  32.05 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.71952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 		 363 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0764  putative transmembrane anti-sigma factor  30.67 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3771  putative transmembrane anti-sigma factor  39.68 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  47.37 
 
 		 271 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  47.37 
 
 		 271 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4280  hypothetical protein  44.44 
 
 		 325 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0890457  normal  0.0241323 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1022  hypothetical protein  44.44 
 
 		 325 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0334  putative transmembrane anti-sigma factor  34 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0219633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3132  putative transmembrane anti-sigma factor  44.44 
 
 		 325 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2076  putative transmembrane anti-sigma factor  44.12 
 
 		 384 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000018802  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1326  hypothetical protein  42.22 
 
 		 465 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000243968  hitchhiker  0.00621187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>