More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3332 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  100 
 
 
567 aa  1129    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  61.31 
 
 
497 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  60.2 
 
 
497 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  58.5 
 
 
499 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  59.6 
 
 
497 aa  558  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  57.91 
 
 
496 aa  544  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  57.29 
 
 
488 aa  537  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  55.71 
 
 
526 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  54.25 
 
 
496 aa  484  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  45.47 
 
 
486 aa  346  8e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  44.19 
 
 
489 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  44.9 
 
 
494 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  41.27 
 
 
475 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  41.1 
 
 
479 aa  323  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  41.7 
 
 
492 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  41.26 
 
 
473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  41.26 
 
 
473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  41.26 
 
 
473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  42.8 
 
 
489 aa  321  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  43.8 
 
 
475 aa  321  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  41.98 
 
 
489 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  42.43 
 
 
474 aa  313  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  41.2 
 
 
477 aa  313  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  43.28 
 
 
503 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  42.24 
 
 
488 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  39.41 
 
 
515 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  39.76 
 
 
503 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  37.94 
 
 
506 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  35.97 
 
 
490 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  37.2 
 
 
486 aa  239  8e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  36.56 
 
 
492 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  36.71 
 
 
477 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 
499 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3504  monooxygenase FAD-binding  38.31 
 
 
515 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  39.14 
 
 
487 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  37.58 
 
 
485 aa  227  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  38.17 
 
 
480 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  36.31 
 
 
493 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  35.67 
 
 
471 aa  223  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  40.16 
 
 
630 aa  223  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  36.29 
 
 
508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  35.97 
 
 
479 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2166  oxygenase  37.06 
 
 
522 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229966  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4465  putative oxygenase  33.65 
 
 
578 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164502  normal  0.0132982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2639  putative oxygenase  35.66 
 
 
515 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  34.62 
 
 
503 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2459  monooxygenase FAD-binding  33.78 
 
 
509 aa  205  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.985145  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  30.51 
 
 
544 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  34.38 
 
 
478 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  34.38 
 
 
478 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  34.9 
 
 
478 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0013  putative monooxygenase  34.03 
 
 
519 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2809  monooxygenase FAD-binding  33.77 
 
 
518 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0721034  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  29.25 
 
 
483 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.78 
 
 
483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2589  monooxygenase FAD-binding  33.78 
 
 
506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388814  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0743  monooxygenase, FAD-binding  35.08 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0301082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  33.81 
 
 
486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  34.88 
 
 
479 aa  197  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  35.13 
 
 
574 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  36.6 
 
 
493 aa  193  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  34.43 
 
 
574 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  31.83 
 
 
571 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  35.08 
 
 
506 aa  191  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  36.6 
 
 
486 aa  190  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  34.66 
 
 
549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  33.03 
 
 
548 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  33.03 
 
 
548 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  33.03 
 
 
548 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  31.01 
 
 
553 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  33.88 
 
 
548 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  33.88 
 
 
548 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  33.07 
 
 
506 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  33.88 
 
 
611 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  33.14 
 
 
500 aa  177  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  31.88 
 
 
550 aa  177  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  38.11 
 
 
481 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  35.42 
 
 
505 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  34.46 
 
 
547 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  35.19 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  34.77 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  33.7 
 
 
548 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  33.7 
 
 
548 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  31.52 
 
 
550 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  34.03 
 
 
968 aa  174  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  37.68 
 
 
529 aa  173  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  33.58 
 
 
548 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  35.12 
 
 
388 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  37.6 
 
 
489 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  33.58 
 
 
538 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  33.58 
 
 
538 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  31.53 
 
 
546 aa  171  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  34.2 
 
 
498 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  31.89 
 
 
505 aa  170  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  31.5 
 
 
552 aa  170  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  32.79 
 
 
501 aa  167  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  31.24 
 
 
502 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.76 
 
 
537 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  30.66 
 
 
502 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  30.16 
 
 
502 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>