More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2585 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
479 aa  941    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  63.77 
 
 
486 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  62.82 
 
 
477 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  55.84 
 
 
485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  56.13 
 
 
493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  50.66 
 
 
480 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  50.54 
 
 
478 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  50.54 
 
 
478 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  50.97 
 
 
478 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  47.55 
 
 
503 aa  362  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  40.12 
 
 
475 aa  279  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  39.88 
 
 
494 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  38.16 
 
 
479 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  38.43 
 
 
489 aa  259  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  37.57 
 
 
497 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  37.65 
 
 
497 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  36.44 
 
 
499 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  38.2 
 
 
473 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  38.2 
 
 
473 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  37.77 
 
 
497 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  38.2 
 
 
473 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  37.24 
 
 
477 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  37.45 
 
 
499 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  38.85 
 
 
486 aa  246  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  38.54 
 
 
506 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  36.46 
 
 
474 aa  243  7.999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  39.35 
 
 
489 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  37.4 
 
 
526 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  38.17 
 
 
475 aa  240  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  37.65 
 
 
574 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  36.49 
 
 
503 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  39.74 
 
 
493 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  33.86 
 
 
544 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  38.82 
 
 
486 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  36.07 
 
 
496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  36.94 
 
 
574 aa  232  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  37.25 
 
 
488 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  37.89 
 
 
505 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  38.06 
 
 
496 aa  227  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  33.83 
 
 
549 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  37.26 
 
 
486 aa  223  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  35.03 
 
 
515 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  37.1 
 
 
550 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  40.26 
 
 
487 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  36.27 
 
 
548 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  36.27 
 
 
548 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  37.04 
 
 
489 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  36.31 
 
 
488 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  36.86 
 
 
550 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  36.27 
 
 
548 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.02 
 
 
483 aa  217  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  39.74 
 
 
388 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  36.27 
 
 
548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  29.44 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  33.52 
 
 
546 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  34.29 
 
 
571 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  36.27 
 
 
611 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  34.51 
 
 
505 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  43.27 
 
 
630 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  36.96 
 
 
567 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  36.03 
 
 
548 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  36.03 
 
 
548 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  33.67 
 
 
490 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.78 
 
 
548 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  36.9 
 
 
414 aa  206  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.78 
 
 
548 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.54 
 
 
538 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  35.54 
 
 
538 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  37.11 
 
 
471 aa  204  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  35.59 
 
 
492 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  35.17 
 
 
492 aa  203  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  32.99 
 
 
503 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  32.7 
 
 
553 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  36.05 
 
 
501 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  32.65 
 
 
461 aa  196  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  33.48 
 
 
529 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  35.75 
 
 
535 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  34.7 
 
 
511 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  34.41 
 
 
518 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  36.24 
 
 
511 aa  193  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  34.03 
 
 
552 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  35.73 
 
 
481 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  34.71 
 
 
506 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  35.07 
 
 
500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  34.46 
 
 
479 aa  179  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  35.97 
 
 
540 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  31.42 
 
 
566 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  40.68 
 
 
546 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  30.75 
 
 
531 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  33.74 
 
 
506 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  34.72 
 
 
557 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  31.26 
 
 
502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  36.69 
 
 
508 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  31.07 
 
 
502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  34.84 
 
 
511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  36.34 
 
 
511 aa  173  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  37.14 
 
 
489 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  31.07 
 
 
502 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  30.68 
 
 
502 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  35.49 
 
 
515 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>