More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2809 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0743  monooxygenase, FAD-binding  68.48 
 
 
509 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0301082 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2639  putative oxygenase  68.11 
 
 
515 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166208 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0013  putative monooxygenase  67.37 
 
 
519 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2589  monooxygenase FAD-binding  71.4 
 
 
506 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388814  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2809  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
518 aa  1036    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0721034  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2459  monooxygenase FAD-binding  59.72 
 
 
509 aa  565  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.985145  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4465  putative oxygenase  53.54 
 
 
578 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164502  normal  0.0132982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2166  oxygenase  48.54 
 
 
522 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229966  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  38.97 
 
 
494 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  40.97 
 
 
508 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  38.49 
 
 
479 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  37.07 
 
 
497 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  36.77 
 
 
497 aa  273  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  37.64 
 
 
477 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  37.03 
 
 
499 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  38.58 
 
 
475 aa  270  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  36.99 
 
 
475 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  38.96 
 
 
473 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  38.96 
 
 
473 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  38.96 
 
 
473 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  35.58 
 
 
486 aa  259  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  38.03 
 
 
489 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  37.75 
 
 
489 aa  257  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  35.65 
 
 
492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  36.33 
 
 
515 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  36.61 
 
 
489 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  36.52 
 
 
488 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  35.69 
 
 
506 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  35.34 
 
 
497 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  38.01 
 
 
474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  34.83 
 
 
496 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  35.27 
 
 
526 aa  240  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  37.33 
 
 
492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  34.22 
 
 
503 aa  229  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  33.84 
 
 
503 aa  226  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  36.96 
 
 
488 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  36.69 
 
 
496 aa  225  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  33.77 
 
 
567 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  31.55 
 
 
490 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  33.57 
 
 
630 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  34.1 
 
 
471 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  34.05 
 
 
487 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
499 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  34.31 
 
 
486 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
477 aa  183  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  34.1 
 
 
485 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  35.71 
 
 
493 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  33.2 
 
 
479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3504  monooxygenase FAD-binding  34.03 
 
 
515 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  32.62 
 
 
479 aa  162  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  33.9 
 
 
478 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  33.72 
 
 
478 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  33.72 
 
 
478 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  34.25 
 
 
480 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  31.18 
 
 
505 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  30.79 
 
 
544 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  31.9 
 
 
503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  33.96 
 
 
481 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  29.42 
 
 
500 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  33.25 
 
 
552 aa  143  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  25.68 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  31.59 
 
 
535 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
493 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  30.54 
 
 
506 aa  140  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 
547 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  30.46 
 
 
512 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.39 
 
 
537 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
461 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  30.39 
 
 
537 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30.39 
 
 
537 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  33.77 
 
 
498 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  32.81 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  26.81 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  31.42 
 
 
489 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  31.52 
 
 
506 aa  134  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  29.98 
 
 
505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 
540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  29.75 
 
 
524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  31.49 
 
 
546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  29.76 
 
 
511 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  31.24 
 
 
547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  28.3 
 
 
566 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  30.48 
 
 
502 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  30.21 
 
 
502 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  30.11 
 
 
501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  33.07 
 
 
508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1535  hypothetical protein  27.49 
 
 
487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  32.61 
 
 
486 aa  127  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  30.48 
 
 
502 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 
477 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  29.95 
 
 
502 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  31.56 
 
 
553 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  27.22 
 
 
968 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  29.76 
 
 
518 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2975  monooxygenase FAD-binding protein  31.58 
 
 
506 aa  123  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0868842  hitchhiker  0.000653809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  30.03 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.79 
 
 
529 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  29.12 
 
 
540 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  30.25 
 
 
414 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  28.08 
 
 
574 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>