More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2841 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  72.52 
 
 		 477 aa  687    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  100 
 
 		 475 aa  946    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  71.55 
 
 		 479 aa  689    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  68.92 
 
 		 473 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  68.92 
 
 		 473 aa  642    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  69.64 
 
 		 489 aa  652    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  68.92 
 
 		 473 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  70.6 
 
 		 489 aa  662    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  65.19 
 
 		 474 aa  612  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  64.56 
 
 		 475 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  64.98 
 
 		 515 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  60.81 
 
 		 488 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  44.49 
 
 		 497 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  45.88 
 
 		 494 aa  362  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  46.53 
 
 		 497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  44 
 
 		 496 aa  354  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  42.91 
 
 		 499 aa  352  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  45.31 
 
 		 486 aa  347  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  43.56 
 
 		 488 aa  345  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  44.42 
 
 		 489 aa  343  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  43.98 
 
 		 526 aa  342  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  45.84 
 
 		 496 aa  341  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  42.37 
 
 		 497 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  43.89 
 
 		 492 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  41.81 
 
 		 506 aa  319  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  42.24 
 
 		 503 aa  309  8e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  41.27 
 
 		 567 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4465  putative oxygenase  39.81 
 
 		 578 aa  280  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164502  normal  0.0132982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2166  oxygenase  41.26 
 
 		 522 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  38.83 
 
 		 477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  41.03 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  35.76 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  39.47 
 
 		 492 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  37.93 
 
 		 503 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  39.16 
 
 		 486 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  40.12 
 
 		 479 aa  265  8.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  40.69 
 
 		 493 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  38.32 
 
 		 478 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  38.32 
 
 		 478 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  34.9 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  39.33 
 
 		 478 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  41.38 
 
 		 487 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  38.34 
 
 		 490 aa  259  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2639  putative oxygenase  38.92 
 
 		 515 aa  256  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166208 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0743  monooxygenase, FAD-binding  40.12 
 
 		 509 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0301082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  37.72 
 
 		 480 aa  247  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2589  monooxygenase FAD-binding  38.24 
 
 		 506 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  37.47 
 
 		 503 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3504  monooxygenase FAD-binding  38.57 
 
 		 515 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  40 
 
 		 630 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  37.77 
 
 		 508 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0013  putative monooxygenase  35.45 
 
 		 519 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  37.01 
 
 		 499 aa  236  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  39 
 
 		 471 aa  234  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2459  monooxygenase FAD-binding  37.02 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.985145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  37.63 
 
 		 479 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2809  monooxygenase FAD-binding  35.44 
 
 		 518 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0721034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  35.67 
 
 		 544 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  37.63 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  37.89 
 
 		 486 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  34.84 
 
 		 505 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  34.55 
 
 		 553 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  32.02 
 
 		 529 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  38.89 
 
 		 481 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  34.03 
 
 		 501 aa  199  7.999999999999999e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  33.02 
 
 		 549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  37.43 
 
 		 574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  34.58 
 
 		 500 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  37.76 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  35.46 
 
 		 486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  34.51 
 
 		 535 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  35.14 
 
 		 505 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  41.4 
 
 		 506 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 548 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 548 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  36.89 
 
 		 552 aa  192  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  34.39 
 
 		 547 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  36.26 
 
 		 611 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  36.55 
 
 		 489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  33.76 
 
 		 388 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.88 
 
 		 548 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.88 
 
 		 548 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  35.54 
 
 		 574 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  34.86 
 
 		 548 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  34.86 
 
 		 548 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  35.59 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.59 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  40.06 
 
 		 498 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  35.1 
 
 		 548 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  32.54 
 
 		 511 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  36.16 
 
 		 512 aa  186  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  34.84 
 
 		 548 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  33.13 
 
 		 506 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  35.7 
 
 		 550 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  35.77 
 
 		 546 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  35.49 
 
 		 968 aa  182  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  35.7 
 
 		 550 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  34.34 
 
 		 540 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  32.02 
 
 		 502 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  32.16 
 
 		 502 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>