More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1172 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  81.09 
 
 		 540 aa  823    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 535 aa  1061    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  31.2 
 
 		 544 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1161  monooxygenase, FAD-binding  79.52 
 
 		 261 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  39.13 
 
 		 511 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  38.25 
 
 		 511 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  34.71 
 
 		 548 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  34.71 
 
 		 548 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  36.31 
 
 		 549 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  34.76 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  34.27 
 
 		 548 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  32.2 
 
 		 574 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  39.11 
 
 		 518 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  35.33 
 
 		 550 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  34.95 
 
 		 550 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  36.16 
 
 		 486 aa  229  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  34.27 
 
 		 546 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  35.41 
 
 		 566 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  35.24 
 
 		 968 aa  228  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  30.67 
 
 		 575 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  39.01 
 
 		 493 aa  226  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 548 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  33.64 
 
 		 611 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 548 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  39.85 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  32.56 
 
 		 574 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  35.95 
 
 		 414 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  33.27 
 
 		 548 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  40.94 
 
 		 486 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  33.27 
 
 		 548 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  33.77 
 
 		 537 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  33.02 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  33.02 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  35.78 
 
 		 571 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  33.58 
 
 		 537 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  33.58 
 
 		 537 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  32.85 
 
 		 547 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  34.45 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  34.53 
 
 		 505 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  37.78 
 
 		 552 aa  205  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  36.55 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  37.63 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  35.33 
 
 		 546 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  36.02 
 
 		 531 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  36.92 
 
 		 497 aa  195  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  34.51 
 
 		 475 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  35.62 
 
 		 499 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  34.87 
 
 		 489 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  35.48 
 
 		 529 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  33.68 
 
 		 477 aa  193  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  36.79 
 
 		 497 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  37.43 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  33.66 
 
 		 486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  32.48 
 
 		 553 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  35.27 
 
 		 497 aa  189  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  36.21 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  36.86 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  32.69 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  35.24 
 
 		 496 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  33.45 
 
 		 511 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  37.5 
 
 		 557 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  34.16 
 
 		 506 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  40.57 
 
 		 481 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  34.93 
 
 		 501 aa  184  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  35.75 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  32.83 
 
 		 488 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  33.26 
 
 		 486 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  31.99 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  38.2 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  35.03 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  34.45 
 
 		 492 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  35.25 
 
 		 478 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  35.25 
 
 		 478 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  35.66 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  34.62 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  34.72 
 
 		 494 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  35.35 
 
 		 506 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  30.88 
 
 		 496 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  34.1 
 
 		 474 aa  173  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  31.67 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1733  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-related FAD-dependent oxidoreductase  39.94 
 
 		 490 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  31.68 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  31.21 
 
 		 506 aa  171  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  34.08 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  35.21 
 
 		 505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  32.59 
 
 		 489 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  36.21 
 
 		 553 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  33.67 
 
 		 488 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  35.23 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2975  monooxygenase FAD-binding protein  33.6 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0868842  hitchhiker  0.000653809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  33.78 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  31.79 
 
 		 489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  34.2 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  34.59 
 
 		 489 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0473  phenol 2-monooxygenase  32.89 
 
 		 693 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  31.76 
 
 		 512 aa  163  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  33.17 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  33.17 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  33.17 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.63 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>