More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1216 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  970    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  61.68 
 
 		 489 aa  578  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  57.2 
 
 		 503 aa  529  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  56.01 
 
 		 492 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  49.9 
 
 		 503 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  46.22 
 
 		 490 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  45.56 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  45.31 
 
 		 475 aa  347  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  45.79 
 
 		 479 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  49.35 
 
 		 630 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  45.4 
 
 		 477 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  43.95 
 
 		 497 aa  333  6e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  45.6 
 
 		 489 aa  332  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  43.68 
 
 		 497 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  43.51 
 
 		 488 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  43.7 
 
 		 497 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  41.98 
 
 		 499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  44.51 
 
 		 475 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  44.56 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  42.17 
 
 		 471 aa  318  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  42.07 
 
 		 496 aa  310  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  43.76 
 
 		 473 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  43.76 
 
 		 473 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  43.76 
 
 		 473 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  45.47 
 
 		 567 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  44.4 
 
 		 526 aa  307  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  42.6 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  41.62 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  40.97 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  41.89 
 
 		 489 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  41.56 
 
 		 492 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  40.85 
 
 		 515 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  41.06 
 
 		 488 aa  279  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  35.28 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2166  oxygenase  40.99 
 
 		 522 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  36.95 
 
 		 499 aa  253  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  34.2 
 
 		 483 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  39.32 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  38.42 
 
 		 508 aa  250  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  41.54 
 
 		 487 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0013  putative monooxygenase  35.59 
 
 		 519 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4465  putative oxygenase  35.87 
 
 		 578 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164502  normal  0.0132982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  39.18 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2639  putative oxygenase  34.8 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  39.72 
 
 		 486 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3504  monooxygenase FAD-binding  41.13 
 
 		 515 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  39.5 
 
 		 493 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0743  monooxygenase, FAD-binding  36.8 
 
 		 509 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0301082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  39.92 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  36.97 
 
 		 478 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2589  monooxygenase FAD-binding  35.48 
 
 		 506 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2809  monooxygenase FAD-binding  35 
 
 		 518 aa  229  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0721034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  38.04 
 
 		 479 aa  226  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  36.77 
 
 		 478 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  36.77 
 
 		 478 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2459  monooxygenase FAD-binding  35.69 
 
 		 509 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.985145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  36.06 
 
 		 503 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  37.08 
 
 		 493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  36.67 
 
 		 486 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  36.25 
 
 		 486 aa  204  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  38.1 
 
 		 574 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  36.55 
 
 		 550 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  36.55 
 
 		 550 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  36.26 
 
 		 549 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  35.54 
 
 		 548 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  35.54 
 
 		 548 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  34.96 
 
 		 574 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  35.23 
 
 		 548 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  35.56 
 
 		 546 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  33.66 
 
 		 535 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  37.63 
 
 		 548 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  34.46 
 
 		 505 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  37.37 
 
 		 548 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  37.37 
 
 		 548 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  37.37 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  28.46 
 
 		 544 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  36.87 
 
 		 548 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  36.87 
 
 		 548 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  34.97 
 
 		 537 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  34.97 
 
 		 537 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  34.97 
 
 		 537 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  37.32 
 
 		 529 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  36.99 
 
 		 540 aa  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  36.62 
 
 		 538 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  36.62 
 
 		 538 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  33.98 
 
 		 547 aa  180  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  33.4 
 
 		 500 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  31.96 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  31.73 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  36.44 
 
 		 553 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  35.43 
 
 		 571 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  36.54 
 
 		 511 aa  174  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  34.79 
 
 		 461 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  34.53 
 
 		 512 aa  173  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  37.16 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  34.99 
 
 		 388 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  34.25 
 
 		 511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  36.39 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  34.45 
 
 		 546 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  32.69 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>