More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3068 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  85.48 
 
 
486 aa  793    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
493 aa  970    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  96.91 
 
 
486 aa  882    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  46.25 
 
 
544 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  43.77 
 
 
461 aa  295  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  37.73 
 
 
574 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  41.59 
 
 
574 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  43.28 
 
 
548 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  43.03 
 
 
548 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  43.03 
 
 
548 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  43.63 
 
 
550 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  43.63 
 
 
550 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  40.38 
 
 
571 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  43.07 
 
 
549 aa  270  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  39.65 
 
 
511 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  41.28 
 
 
548 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  41.28 
 
 
548 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  41.28 
 
 
611 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  37.52 
 
 
546 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  40.54 
 
 
548 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  41.12 
 
 
388 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  40.79 
 
 
548 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  40.79 
 
 
548 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  40.54 
 
 
538 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  40.54 
 
 
538 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  43.5 
 
 
553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  47.09 
 
 
552 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  37.93 
 
 
485 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  33.99 
 
 
566 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  39.31 
 
 
518 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  34.13 
 
 
511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  39.8 
 
 
414 aa  240  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  42.98 
 
 
968 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  39.01 
 
 
535 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  37.27 
 
 
481 aa  230  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  38 
 
 
478 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  37.79 
 
 
478 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  37.79 
 
 
478 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  39.39 
 
 
503 aa  227  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  43.1 
 
 
537 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  43.1 
 
 
537 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  43.1 
 
 
537 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  39.85 
 
 
505 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  40.72 
 
 
547 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  40.51 
 
 
479 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  39.85 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  42.05 
 
 
493 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  38.31 
 
 
506 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  38.86 
 
 
531 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  37.87 
 
 
477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  40.74 
 
 
511 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  37.21 
 
 
486 aa  216  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  37.13 
 
 
480 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  37.79 
 
 
475 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  41.42 
 
 
546 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1733  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-related FAD-dependent oxidoreductase  41.81 
 
 
490 aa  210  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  36.82 
 
 
540 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  38.33 
 
 
475 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  38.22 
 
 
501 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  37.11 
 
 
489 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  37.5 
 
 
486 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  40.1 
 
 
489 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  38.19 
 
 
497 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  39.7 
 
 
477 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  36.46 
 
 
522 aa  206  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  39 
 
 
511 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  37.63 
 
 
489 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  33.13 
 
 
500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  37.03 
 
 
497 aa  200  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  37.06 
 
 
497 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  33.33 
 
 
502 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  37.07 
 
 
515 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  33.33 
 
 
502 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  33.33 
 
 
502 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  39.52 
 
 
547 aa  193  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  35.92 
 
 
477 aa  193  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  39.26 
 
 
487 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  31.25 
 
 
575 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  37.84 
 
 
496 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.08 
 
 
510 aa  189  7e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  38.59 
 
 
502 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  37.04 
 
 
494 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  34.15 
 
 
506 aa  187  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2975  monooxygenase FAD-binding protein  35.1 
 
 
506 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0868842  hitchhiker  0.000653809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  36.24 
 
 
512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  34.28 
 
 
526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  36.16 
 
 
529 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  38.13 
 
 
496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  37.95 
 
 
488 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  35.68 
 
 
474 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1511  monooxygenase FAD-binding  38.55 
 
 
576 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0685394  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  35.41 
 
 
499 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  35.34 
 
 
505 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  36.41 
 
 
473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  36.41 
 
 
473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  36.41 
 
 
473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  31.3 
 
 
553 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  36.34 
 
 
479 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  34.24 
 
 
483 aa  177  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  35.95 
 
 
488 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>