More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5043 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 505 aa  1015    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  35.97 
 
 		 544 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  36.17 
 
 		 571 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  39.85 
 
 		 493 aa  223  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  35.5 
 
 		 506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  31.98 
 
 		 574 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  34.18 
 
 		 546 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  39.34 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  34.96 
 
 		 548 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  34.96 
 
 		 548 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  33.8 
 
 		 574 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  34.24 
 
 		 498 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  40.29 
 
 		 486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  36.08 
 
 		 485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  34.92 
 
 		 537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  34.92 
 
 		 537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  34.3 
 
 		 529 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  34.77 
 
 		 548 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  34.11 
 
 		 508 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  34.45 
 
 		 553 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  35.7 
 
 		 512 aa  213  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  34.52 
 
 		 537 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  33.78 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  36.9 
 
 		 968 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  33.98 
 
 		 549 aa  210  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  36.25 
 
 		 481 aa  209  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  36.33 
 
 		 477 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  33.66 
 
 		 550 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  33.46 
 
 		 550 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  34.83 
 
 		 500 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  34.53 
 
 		 535 aa  205  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  34.37 
 
 		 548 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  34.37 
 
 		 548 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  34.3 
 
 		 548 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  34.37 
 
 		 538 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  34.37 
 
 		 538 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  34.3 
 
 		 548 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  34.37 
 
 		 611 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  36.28 
 
 		 548 aa  203  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  33.67 
 
 		 502 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  38.55 
 
 		 493 aa  200  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  36.78 
 
 		 486 aa  200  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  33.53 
 
 		 480 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  36.28 
 
 		 546 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  33.67 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  36.22 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  33.2 
 
 		 502 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  33.61 
 
 		 502 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  35.58 
 
 		 477 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  35.07 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  35.14 
 
 		 475 aa  194  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  35.13 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  33.4 
 
 		 479 aa  190  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  36.87 
 
 		 518 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  35.1 
 
 		 479 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  37.5 
 
 		 522 aa  186  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  34.76 
 
 		 414 aa  186  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  33.08 
 
 		 553 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  33.07 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  32.92 
 
 		 475 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  35.22 
 
 		 540 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  32.65 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  33.84 
 
 		 557 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 547 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  38.78 
 
 		 489 aa  180  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  32.33 
 
 		 497 aa  180  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  33.02 
 
 		 511 aa  179  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 		 489 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  32.73 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  31.73 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  33.9 
 
 		 478 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  33.9 
 
 		 478 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  32.14 
 
 		 497 aa  176  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  34.94 
 
 		 388 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  34.46 
 
 		 511 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  33.75 
 
 		 478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  32.93 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  32.8 
 
 		 503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  32.39 
 
 		 501 aa  174  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  32.76 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  34.98 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  35.04 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  30.05 
 
 		 566 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  28.85 
 
 		 537 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  28.28 
 
 		 575 aa  170  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  35.92 
 
 		 531 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  36.52 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  35.01 
 
 		 515 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  32.01 
 
 		 473 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  32.01 
 
 		 473 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  32.01 
 
 		 473 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 		 533 aa  163  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  31.61 
 
 		 488 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  31.92 
 
 		 489 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1535  hypothetical protein  29.75 
 
 		 487 aa  160  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  31.72 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  31.21 
 
 		 506 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  33.91 
 
 		 488 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.66 
 
 		 483 aa  157  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 499 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>