More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1544 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  100 
 
 
478 aa  947    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  95.19 
 
 
478 aa  897    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
478 aa  947    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  58.02 
 
 
503 aa  526  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  49.68 
 
 
479 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  49.05 
 
 
493 aa  349  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  46.43 
 
 
485 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  47.64 
 
 
477 aa  326  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  43.75 
 
 
480 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  46.79 
 
 
486 aa  317  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  38.32 
 
 
475 aa  264  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  37.55 
 
 
479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  39.02 
 
 
494 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  37.07 
 
 
473 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  37.07 
 
 
473 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  37.07 
 
 
473 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  38.25 
 
 
489 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  37.16 
 
 
475 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  38.09 
 
 
497 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  36.83 
 
 
489 aa  229  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  36.21 
 
 
574 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  35.88 
 
 
477 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  37.14 
 
 
497 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  36.77 
 
 
486 aa  226  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  38.27 
 
 
548 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  38.17 
 
 
548 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  38.17 
 
 
548 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  35.73 
 
 
574 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  37.7 
 
 
496 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  36.76 
 
 
499 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  40.2 
 
 
549 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  36.98 
 
 
488 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  37.58 
 
 
493 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  36.25 
 
 
497 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  37.37 
 
 
486 aa  216  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  36.48 
 
 
506 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  37.76 
 
 
546 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  36.92 
 
 
486 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  33.92 
 
 
544 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  37.24 
 
 
550 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  34.12 
 
 
503 aa  209  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  36.99 
 
 
550 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  36.74 
 
 
526 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  38.61 
 
 
548 aa  206  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  35.86 
 
 
489 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  33.25 
 
 
571 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  34.48 
 
 
515 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  37.91 
 
 
611 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  37.66 
 
 
548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  37.66 
 
 
548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  37.91 
 
 
548 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  37.91 
 
 
548 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  37.41 
 
 
538 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  37.41 
 
 
538 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  37.7 
 
 
511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.46 
 
 
483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  34.78 
 
 
481 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  33.76 
 
 
474 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  34.93 
 
 
518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  34.35 
 
 
496 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  29.89 
 
 
483 aa  190  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.214491 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  32.29 
 
 
566 aa  190  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  34.17 
 
 
505 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  34.83 
 
 
487 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  37.22 
 
 
461 aa  186  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  33.08 
 
 
414 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  37.56 
 
 
630 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  37.32 
 
 
511 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  33.2 
 
 
506 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  35.25 
 
 
535 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  34.43 
 
 
501 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  31.81 
 
 
502 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  31.81 
 
 
502 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  31.81 
 
 
502 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 
499 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  33.9 
 
 
505 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  36.6 
 
 
388 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  31.41 
 
 
502 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  35.93 
 
 
529 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  36.11 
 
 
553 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  32.91 
 
 
488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  36.17 
 
 
537 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  36.17 
 
 
537 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  34.38 
 
 
567 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  37.11 
 
 
489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  36.76 
 
 
537 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  33 
 
 
498 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  36.89 
 
 
552 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  33.82 
 
 
492 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  32.38 
 
 
492 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  32.67 
 
 
490 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  34.1 
 
 
471 aa  169  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  39.2 
 
 
546 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  34.01 
 
 
531 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  33.13 
 
 
503 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  35.19 
 
 
479 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  33.8 
 
 
547 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  32.8 
 
 
512 aa  163  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  34 
 
 
477 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  32.93 
 
 
508 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>