More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5698 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 531 aa  1060    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  36.5 
 
 		 552 aa  240  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  31.29 
 
 		 544 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  36.54 
 
 		 557 aa  236  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  33.14 
 
 		 511 aa  220  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  38.78 
 
 		 461 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  39.32 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  38.86 
 
 		 493 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  37.67 
 
 		 547 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  37.87 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  37.4 
 
 		 486 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  33.27 
 
 		 549 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  36.02 
 
 		 535 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  34.68 
 
 		 548 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  34.43 
 
 		 548 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  34.43 
 
 		 548 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  34.43 
 
 		 611 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  31.27 
 
 		 574 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  29.96 
 
 		 548 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  29.96 
 
 		 548 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  33.89 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  35.46 
 
 		 518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  34.09 
 
 		 566 aa  190  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  33.92 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  29.59 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  33.89 
 
 		 537 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  33.92 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  33.89 
 
 		 537 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  36.83 
 
 		 553 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  33.89 
 
 		 537 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  35.71 
 
 		 511 aa  187  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  30.52 
 
 		 574 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  29 
 
 		 571 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32.07 
 
 		 546 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  34.1 
 
 		 538 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  34.1 
 
 		 538 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  31.65 
 
 		 968 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  30.58 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  30.58 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  32.33 
 
 		 479 aa  180  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  31.33 
 
 		 522 aa  179  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  31.06 
 
 		 546 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  29.23 
 
 		 553 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  34.22 
 
 		 486 aa  177  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  34.77 
 
 		 540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  33.57 
 
 		 511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.63 
 
 		 529 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2975  monooxygenase FAD-binding protein  34.38 
 
 		 506 aa  173  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0868842  hitchhiker  0.000653809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  34.76 
 
 		 478 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  33.82 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.08 
 
 		 475 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  34.01 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  35.92 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  34.01 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  34.68 
 
 		 489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  32.53 
 
 		 479 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  31.58 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  31.36 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  31.35 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  30.14 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  28.51 
 
 		 515 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  29.51 
 
 		 489 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  33.79 
 
 		 511 aa  160  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  30.95 
 
 		 489 aa  160  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  32.19 
 
 		 506 aa  159  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  32.08 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  30.48 
 
 		 497 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  30.4 
 
 		 485 aa  156  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  34.71 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  32.84 
 
 		 481 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  30.36 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  28.96 
 
 		 547 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  29.61 
 
 		 497 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  30.62 
 
 		 503 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  31.74 
 
 		 505 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  33.93 
 
 		 501 aa  154  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  30.75 
 
 		 473 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  30.75 
 
 		 473 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  30.75 
 
 		 473 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  31.4 
 
 		 547 aa  153  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  29.82 
 
 		 575 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 551 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.42 
 
 		 554 aa  152  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  30.93 
 
 		 526 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  27.13 
 
 		 474 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1733  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-related FAD-dependent oxidoreductase  37.22 
 
 		 490 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.33 
 
 		 510 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  31.47 
 
 		 493 aa  150  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  28.8 
 
 		 486 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  32.42 
 
 		 630 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  33.01 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  30.9 
 
 		 490 aa  148  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1511  monooxygenase FAD-binding  31.59 
 
 		 576 aa  148  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0685394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  31.02 
 
 		 503 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  31.83 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  33.43 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 550 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 541 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>