More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3217 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  75.37 
 
 
474 aa  687    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
488 aa  969    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  74.64 
 
 
515 aa  683    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  62.71 
 
 
477 aa  587  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  62.47 
 
 
479 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  60.81 
 
 
475 aa  569  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  62.42 
 
 
489 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  61.44 
 
 
475 aa  549  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  61.18 
 
 
489 aa  551  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  60.47 
 
 
473 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  60.47 
 
 
473 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  60.47 
 
 
473 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  41.88 
 
 
497 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  44.58 
 
 
496 aa  316  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  41.99 
 
 
497 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  44.22 
 
 
494 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  42.74 
 
 
488 aa  309  9e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  43.2 
 
 
497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  43.8 
 
 
496 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  41.63 
 
 
526 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  38.63 
 
 
499 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  41.78 
 
 
486 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  42.24 
 
 
567 aa  289  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  39.8 
 
 
489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  40.96 
 
 
506 aa  279  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  39.84 
 
 
492 aa  269  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  40.36 
 
 
503 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  41.07 
 
 
492 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2166  oxygenase  42.08 
 
 
522 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229966  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  37.97 
 
 
503 aa  249  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  37.99 
 
 
486 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  36.79 
 
 
477 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  38.51 
 
 
485 aa  239  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4465  putative oxygenase  37.23 
 
 
578 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164502  normal  0.0132982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2639  putative oxygenase  36.45 
 
 
515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  37.27 
 
 
490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0743  monooxygenase, FAD-binding  38.33 
 
 
509 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0301082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2459  monooxygenase FAD-binding  37.28 
 
 
509 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.985145  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  38.05 
 
 
471 aa  227  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0013  putative monooxygenase  36.36 
 
 
519 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  38.03 
 
 
493 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  40.04 
 
 
487 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  32.17 
 
 
483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.12 
 
 
483 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  36.33 
 
 
479 aa  221  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  37.4 
 
 
508 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3504  monooxygenase FAD-binding  38.74 
 
 
515 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2589  monooxygenase FAD-binding  35.79 
 
 
506 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388814  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2809  monooxygenase FAD-binding  36.38 
 
 
518 aa  213  9e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0721034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  38.65 
 
 
630 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  34.32 
 
 
505 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 
499 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  35.98 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  37.7 
 
 
552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  30.05 
 
 
544 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  37.95 
 
 
493 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  34.65 
 
 
479 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  35.05 
 
 
548 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  35.05 
 
 
548 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  33.73 
 
 
500 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  33.89 
 
 
478 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  35.05 
 
 
611 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  32.55 
 
 
529 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  34.96 
 
 
548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  34.96 
 
 
548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  33.75 
 
 
478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  33.75 
 
 
478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  37.32 
 
 
538 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  28.97 
 
 
547 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  37.32 
 
 
538 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  34.69 
 
 
553 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  37.69 
 
 
486 aa  183  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  34.21 
 
 
501 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  39.42 
 
 
506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  34.39 
 
 
506 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  36.26 
 
 
548 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  33.92 
 
 
548 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  33.92 
 
 
548 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  34.45 
 
 
574 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  37.47 
 
 
549 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  33.75 
 
 
548 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  33.17 
 
 
461 aa  176  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  33.06 
 
 
503 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  39.94 
 
 
481 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 
550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  32.74 
 
 
537 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  32.74 
 
 
537 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  31.41 
 
 
550 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  32.74 
 
 
537 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  36.67 
 
 
486 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  31.36 
 
 
574 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  32.27 
 
 
502 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  36.13 
 
 
489 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  37.43 
 
 
498 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  33.67 
 
 
535 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  33.68 
 
 
388 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  31.87 
 
 
502 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  32.47 
 
 
502 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  32.27 
 
 
502 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2907  hypothetical protein  28.57 
 
 
477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>