More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6034 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
489 aa  957    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  53.6 
 
 
506 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  47.83 
 
 
500 aa  347  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  47.96 
 
 
511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  39.14 
 
 
388 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  35.73 
 
 
544 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  40.66 
 
 
501 aa  213  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  39.31 
 
 
461 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  39.94 
 
 
546 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  37.67 
 
 
486 aa  207  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  37.11 
 
 
493 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  36.53 
 
 
518 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  37.67 
 
 
537 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  37.67 
 
 
537 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  37.67 
 
 
537 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  39.12 
 
 
511 aa  200  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  37.23 
 
 
486 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  36.83 
 
 
511 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  32.74 
 
 
414 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  36.55 
 
 
475 aa  191  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  38.46 
 
 
489 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  37.8 
 
 
549 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  37.28 
 
 
550 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1733  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-related FAD-dependent oxidoreductase  38.84 
 
 
490 aa  179  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  39.06 
 
 
505 aa  179  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  35.2 
 
 
548 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  35.9 
 
 
548 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  37.11 
 
 
473 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  37.11 
 
 
473 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  35.9 
 
 
548 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  37.11 
 
 
473 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  37.02 
 
 
550 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  36.39 
 
 
474 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  39.83 
 
 
481 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  36.44 
 
 
529 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  35.54 
 
 
547 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  37.37 
 
 
478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  37.57 
 
 
497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  37.57 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  36.53 
 
 
477 aa  174  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  35.4 
 
 
546 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  37.5 
 
 
477 aa  173  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  35.73 
 
 
547 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  35.34 
 
 
515 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  38.28 
 
 
494 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  34.77 
 
 
968 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  37.11 
 
 
478 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  37.11 
 
 
478 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  35.64 
 
 
497 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  35.29 
 
 
553 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  36.08 
 
 
479 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  39.32 
 
 
497 aa  170  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  36 
 
 
506 aa  170  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  36.13 
 
 
488 aa  170  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  38.29 
 
 
480 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
569 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  35.55 
 
 
611 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  35.86 
 
 
489 aa  169  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  35.55 
 
 
548 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  35.55 
 
 
548 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.66 
 
 
548 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.66 
 
 
548 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  35.54 
 
 
511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  36.01 
 
 
548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  31.59 
 
 
566 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  32.59 
 
 
535 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  34.68 
 
 
531 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  32.23 
 
 
557 aa  167  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  35.4 
 
 
538 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  35.33 
 
 
553 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.4 
 
 
538 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  31.92 
 
 
569 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2975  monooxygenase FAD-binding protein  35.06 
 
 
506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0868842  hitchhiker  0.000653809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  31.8 
 
 
574 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  35.01 
 
 
506 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  39.14 
 
 
477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  36.7 
 
 
475 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  35 
 
 
552 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  35.5 
 
 
526 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  33.6 
 
 
540 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
545 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  32.71 
 
 
512 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  32.25 
 
 
541 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  32.82 
 
 
574 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  35.79 
 
 
496 aa  160  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  37.47 
 
 
503 aa  159  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  33 
 
 
571 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  31.35 
 
 
575 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  33.8 
 
 
551 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  32.58 
 
 
540 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  33.06 
 
 
555 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35.23 
 
 
510 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
570 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  33.06 
 
 
558 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  35.07 
 
 
561 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  35.14 
 
 
499 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  34.71 
 
 
522 aa  157  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
553 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
553 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  38.34 
 
 
486 aa  156  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>