More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3048 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  68.61 
 
 		 498 aa  684    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  68.51 
 
 		 504 aa  682    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  67.14 
 
 		 508 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1009    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  56.85 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  57.26 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  57.06 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  57.26 
 
 		 502 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  47.77 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  46.15 
 
 		 529 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  47.06 
 
 		 481 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  45.63 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  42.89 
 
 		 512 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  41.13 
 
 		 546 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  33.46 
 
 		 537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  33.46 
 
 		 537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  32.66 
 
 		 544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  33.64 
 
 		 537 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  37.28 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  35.81 
 
 		 552 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  35.5 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  41.8 
 
 		 489 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  36.11 
 
 		 501 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  35.75 
 
 		 511 aa  206  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  37.35 
 
 		 511 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  36.67 
 
 		 968 aa  202  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  40.91 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  32.51 
 
 		 547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  36.43 
 
 		 548 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  36.43 
 
 		 548 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  36.43 
 
 		 611 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  36.04 
 
 		 549 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  36.5 
 
 		 548 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  36.5 
 
 		 548 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  36.31 
 
 		 538 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  32.49 
 
 		 574 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  36.31 
 
 		 538 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  41.4 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  36 
 
 		 548 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  40.41 
 
 		 477 aa  193  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  32.72 
 
 		 571 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  35.24 
 
 		 518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  32.84 
 
 		 511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 574 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  35.14 
 
 		 473 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  35.14 
 
 		 473 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  35.14 
 
 		 473 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  35.48 
 
 		 499 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  39.94 
 
 		 474 aa  189  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  39.77 
 
 		 515 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  35.15 
 
 		 497 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  34.34 
 
 		 493 aa  187  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  34.09 
 
 		 548 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  34.1 
 
 		 548 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  34.1 
 
 		 548 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  39.66 
 
 		 494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  30.18 
 
 		 566 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  38.66 
 
 		 489 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  31.58 
 
 		 575 aa  184  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  33.52 
 
 		 546 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  38.1 
 
 		 511 aa  183  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  34.07 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  33.4 
 
 		 550 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  34.93 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  39.42 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  33.2 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  33.2 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  33.9 
 
 		 550 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  33.65 
 
 		 486 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  36.14 
 
 		 486 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  34.14 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  35.09 
 
 		 480 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  35.35 
 
 		 535 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  36.71 
 
 		 496 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  33.2 
 
 		 485 aa  174  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  36.97 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  36.15 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  34.74 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  36 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  32.6 
 
 		 503 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  31.8 
 
 		 486 aa  170  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  33.08 
 
 		 506 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  35.95 
 
 		 526 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  35.8 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  31.59 
 
 		 522 aa  166  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  36.39 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  35.08 
 
 		 567 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  40 
 
 		 493 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  33.72 
 
 		 541 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  32.35 
 
 		 488 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  34.02 
 
 		 489 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  32.52 
 
 		 479 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.1 
 
 		 539 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.93 
 
 		 555 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.2 
 
 		 539 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.46 
 
 		 539 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2975  monooxygenase FAD-binding protein  36.62 
 
 		 506 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0868842  hitchhiker  0.000653809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  28.72 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.214491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>