More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4529 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  67.27 
 
 		 553 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 559 aa  1142    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  83.03 
 
 		 563 aa  899    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  67.27 
 
 		 553 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  67.27 
 
 		 553 aa  734    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  67.27 
 
 		 553 aa  734    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  66.67 
 
 		 579 aa  744    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  67.81 
 
 		 553 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  69.68 
 
 		 550 aa  738    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  67.27 
 
 		 553 aa  736    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  63.79 
 
 		 558 aa  669    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  63 
 
 		 578 aa  650    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  66.3 
 
 		 553 aa  726    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  67.81 
 
 		 553 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  69.49 
 
 		 553 aa  744    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  65.5 
 
 		 563 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  69.86 
 
 		 569 aa  789    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  68.01 
 
 		 569 aa  773    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  67.95 
 
 		 584 aa  749    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  69.68 
 
 		 553 aa  748    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  68.75 
 
 		 570 aa  766    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  60.15 
 
 		 535 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  69.13 
 
 		 555 aa  742    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  69.13 
 
 		 558 aa  745    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  69.68 
 
 		 553 aa  748    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  69.57 
 
 		 555 aa  754    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  63.8 
 
 		 545 aa  680    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 559 aa  1142    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  59.3 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  57.17 
 
 		 545 aa  616  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  55.43 
 
 		 540 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  58.06 
 
 		 554 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  57.81 
 
 		 540 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  53.82 
 
 		 541 aa  558  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  56.77 
 
 		 535 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  53.54 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  55.69 
 
 		 535 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  54.86 
 
 		 544 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  52.08 
 
 		 524 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  51.18 
 
 		 546 aa  497  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  50 
 
 		 541 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  43.05 
 
 		 550 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  42.49 
 
 		 550 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  40.21 
 
 		 577 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 564 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  41.94 
 
 		 561 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  39.3 
 
 		 570 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 581 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  39.06 
 
 		 588 aa  355  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 551 aa  354  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  38.68 
 
 		 583 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  39.13 
 
 		 585 aa  349  8e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  37.75 
 
 		 578 aa  339  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  40.04 
 
 		 586 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  39.05 
 
 		 554 aa  327  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  40.3 
 
 		 547 aa  313  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  37.04 
 
 		 572 aa  313  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  38.91 
 
 		 594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  36.29 
 
 		 557 aa  296  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  35.58 
 
 		 525 aa  239  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  35.51 
 
 		 484 aa  233  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  31.44 
 
 		 504 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  33.15 
 
 		 550 aa  190  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  32.9 
 
 		 550 aa  190  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  32.28 
 
 		 548 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  31.84 
 
 		 546 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  31.9 
 
 		 548 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  31.9 
 
 		 548 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  31.43 
 
 		 549 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  34.67 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  30.42 
 
 		 574 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 548 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 548 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  32.28 
 
 		 611 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  31.54 
 
 		 547 aa  170  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  32.09 
 
 		 548 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  32.09 
 
 		 548 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  33.87 
 
 		 414 aa  167  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  28.75 
 
 		 574 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  31.79 
 
 		 537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  35.46 
 
 		 480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  32.06 
 
 		 489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  31.78 
 
 		 538 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  31.78 
 
 		 538 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  30.19 
 
 		 494 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  31.08 
 
 		 506 aa  164  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  29.22 
 
 		 571 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  32.56 
 
 		 533 aa  160  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  30.41 
 
 		 548 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.59 
 
 		 605 aa  159  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  34.37 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  32.89 
 
 		 537 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.11 
 
 		 552 aa  158  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  32.28 
 
 		 537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.35 
 
 		 573 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  32.28 
 
 		 537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.35 
 
 		 573 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  31.49 
 
 		 477 aa  157  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  34.75 
 
 		 486 aa  157  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.3 
 
 		 568 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>