More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9228 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  75.65 
 
 		 508 aa  747    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  1013    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  77.02 
 
 		 498 aa  782    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  68.51 
 
 		 506 aa  694    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  56.71 
 
 		 502 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  56.51 
 
 		 502 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  55.91 
 
 		 502 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  56.51 
 
 		 502 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  42.91 
 
 		 529 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  42.64 
 
 		 553 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  43.6 
 
 		 481 aa  344  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  43.78 
 
 		 477 aa  341  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  40.68 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  39.74 
 
 		 546 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  32.06 
 
 		 544 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  32.54 
 
 		 537 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  32.54 
 
 		 537 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  32.72 
 
 		 537 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  33.88 
 
 		 552 aa  209  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  37.27 
 
 		 511 aa  203  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  39.89 
 
 		 489 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  34.72 
 
 		 461 aa  200  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  32.42 
 
 		 547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  33.27 
 
 		 505 aa  193  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  34.47 
 
 		 501 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  33.67 
 
 		 503 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  35 
 
 		 968 aa  186  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  39.24 
 
 		 475 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  34.6 
 
 		 494 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  32.45 
 
 		 511 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  38.48 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  33.88 
 
 		 489 aa  183  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  38.95 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  36.77 
 
 		 388 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  37.03 
 
 		 515 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  33.72 
 
 		 574 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  31.16 
 
 		 574 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  32.81 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  36.92 
 
 		 474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  38.51 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  33.72 
 
 		 571 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  31.49 
 
 		 518 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  29.78 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  35.03 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  30.1 
 
 		 566 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  33.6 
 
 		 497 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  32.02 
 
 		 522 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  34.5 
 
 		 493 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  33.33 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  31.65 
 
 		 548 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  31.65 
 
 		 548 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  38.04 
 
 		 488 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  33.4 
 
 		 549 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  34.25 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  32.66 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  29.56 
 
 		 575 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  30.99 
 
 		 548 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  34 
 
 		 548 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  34 
 
 		 548 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  34 
 
 		 548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  34 
 
 		 548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  33.8 
 
 		 497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.01 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  33.77 
 
 		 538 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  33.77 
 
 		 538 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  33.77 
 
 		 611 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.83 
 
 		 554 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.83 
 
 		 554 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.83 
 
 		 554 aa  163  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  32.76 
 
 		 548 aa  163  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  36.54 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  37.94 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  35.32 
 
 		 493 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  31.44 
 
 		 546 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  35.01 
 
 		 478 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  33.47 
 
 		 497 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.64 
 
 		 554 aa  161  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  31.99 
 
 		 478 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  31.99 
 
 		 478 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  30.64 
 
 		 554 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  30.97 
 
 		 506 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.64 
 
 		 554 aa  159  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  30.64 
 
 		 554 aa  159  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  34.98 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  33.9 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  33.06 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  36.31 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  28.72 
 
 		 483 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  34.68 
 
 		 535 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  32.89 
 
 		 550 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.22 
 
 		 483 aa  156  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  32.24 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  32.67 
 
 		 550 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  32.23 
 
 		 541 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  32.33 
 
 		 477 aa  153  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.52 
 
 		 539 aa  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  32.58 
 
 		 486 aa  153  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  30.17 
 
 		 547 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>