More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1979 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  68.72 
 
 		 554 aa  798    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  68.54 
 
 		 554 aa  798    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  68.72 
 
 		 554 aa  800    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  55.29 
 
 		 618 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 		 555 aa  1135    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  68.72 
 
 		 554 aa  800    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  55.21 
 
 		 622 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  68.72 
 
 		 554 aa  800    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  69.08 
 
 		 554 aa  803    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  68.72 
 
 		 554 aa  798    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  68.54 
 
 		 554 aa  795    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  54.31 
 
 		 615 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  50.95 
 
 		 569 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  49.91 
 
 		 561 aa  531  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  49.43 
 
 		 568 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  49.44 
 
 		 573 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  49.44 
 
 		 573 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  49.52 
 
 		 574 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  49.9 
 
 		 569 aa  512  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  44.19 
 
 		 542 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  44.19 
 
 		 542 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  42.7 
 
 		 564 aa  422  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.44 
 
 		 552 aa  359  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.88 
 
 		 605 aa  331  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.23 
 
 		 580 aa  323  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  35.96 
 
 		 587 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  37.67 
 
 		 547 aa  319  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  33.99 
 
 		 547 aa  259  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  32.88 
 
 		 520 aa  258  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  35.63 
 
 		 570 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  35.63 
 
 		 570 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  36.09 
 
 		 565 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.34 
 
 		 509 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  32.75 
 
 		 520 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  34.77 
 
 		 537 aa  230  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  32.1 
 
 		 497 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  30.94 
 
 		 525 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.89 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  30.78 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  31.64 
 
 		 514 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.99 
 
 		 530 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.58 
 
 		 507 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.63 
 
 		 555 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  30.02 
 
 		 530 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  30.43 
 
 		 518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  30.38 
 
 		 481 aa  190  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.01 
 
 		 597 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.91 
 
 		 511 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  31.23 
 
 		 537 aa  180  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  29.12 
 
 		 503 aa  180  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.87 
 
 		 555 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33 
 
 		 523 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 564 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 570 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  35.93 
 
 		 506 aa  160  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 588 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 577 aa  148  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 561 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 559 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 559 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  33.14 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  28.42 
 
 		 547 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  29.35 
 
 		 572 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  32.53 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  35.04 
 
 		 504 aa  143  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 		 552 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  27 
 
 		 575 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 581 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  30.32 
 
 		 553 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  30.11 
 
 		 511 aa  140  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 555 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  31.65 
 
 		 506 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 545 aa  138  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  27.13 
 
 		 578 aa  138  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  34.76 
 
 		 481 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.55 
 
 		 529 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 569 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  33.43 
 
 		 486 aa  137  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 555 aa  137  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  32.43 
 
 		 512 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 558 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.27 
 
 		 475 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  32.87 
 
 		 498 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 579 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  33.33 
 
 		 515 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  34 
 
 		 473 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  34 
 
 		 473 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  34 
 
 		 473 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.08 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  32.37 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  27.92 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  31 
 
 		 569 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 540 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  33.98 
 
 		 488 aa  133  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  28.43 
 
 		 535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.42 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30.42 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>