More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0378 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 		 554 aa  1147    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  99.1 
 
 		 554 aa  1136    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  99.1 
 
 		 554 aa  1137    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  99.1 
 
 		 554 aa  1138    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  99.1 
 
 		 554 aa  1138    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  99.1 
 
 		 554 aa  1137    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  98.92 
 
 		 554 aa  1136    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  69.08 
 
 		 555 aa  803    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  99.1 
 
 		 554 aa  1138    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  54.21 
 
 		 622 aa  631  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.53 
 
 		 618 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  52.9 
 
 		 615 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.73 
 
 		 569 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.74 
 
 		 568 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.74 
 
 		 573 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.69 
 
 		 561 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.74 
 
 		 573 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.61 
 
 		 569 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.52 
 
 		 574 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  43.88 
 
 		 542 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  43.88 
 
 		 542 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  40.9 
 
 		 564 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.52 
 
 		 552 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.74 
 
 		 605 aa  341  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.89 
 
 		 580 aa  338  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  37.38 
 
 		 547 aa  327  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  35.02 
 
 		 587 aa  323  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  32.76 
 
 		 520 aa  269  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  32.2 
 
 		 547 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  33.49 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  33.49 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  33.72 
 
 		 565 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.58 
 
 		 503 aa  233  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  32.78 
 
 		 537 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  30.74 
 
 		 520 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.38 
 
 		 509 aa  226  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.3 
 
 		 530 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  29.14 
 
 		 525 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  31.1 
 
 		 530 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  30.96 
 
 		 514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.25 
 
 		 507 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  30.92 
 
 		 481 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  29.45 
 
 		 509 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  32.51 
 
 		 497 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.94 
 
 		 555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.42 
 
 		 597 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 		 518 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  30.24 
 
 		 537 aa  187  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.17 
 
 		 555 aa  186  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.86 
 
 		 523 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.71 
 
 		 511 aa  176  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  31.1 
 
 		 503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 577 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  31.01 
 
 		 504 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 541 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  29.97 
 
 		 535 aa  153  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  35.26 
 
 		 506 aa  153  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  32.26 
 
 		 537 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 583 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  28.89 
 
 		 547 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 564 aa  150  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 581 aa  150  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 588 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  27.78 
 
 		 572 aa  148  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  28.85 
 
 		 498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  31.7 
 
 		 506 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 540 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 524 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 559 aa  144  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 559 aa  144  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  28.07 
 
 		 546 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 		 544 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 561 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  34.11 
 
 		 479 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  33.79 
 
 		 529 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  33.42 
 
 		 508 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 555 aa  139  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 545 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 545 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  30.62 
 
 		 537 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30.62 
 
 		 537 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  30.73 
 
 		 475 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  32.19 
 
 		 481 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  25.81 
 
 		 578 aa  137  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 570 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  31.44 
 
 		 537 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 550 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  31.75 
 
 		 533 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  30.47 
 
 		 489 aa  134  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  29.34 
 
 		 522 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  29.14 
 
 		 502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  30.64 
 
 		 574 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  30.66 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  31.99 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>