More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7425 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 
503 aa  1033    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.25 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.55 
 
 
509 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  37.21 
 
 
497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  36.01 
 
 
520 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  37.65 
 
 
530 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  35.77 
 
 
503 aa  295  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  37.57 
 
 
514 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  34.5 
 
 
518 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  34.71 
 
 
509 aa  269  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  35.71 
 
 
525 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.09 
 
 
530 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  33.88 
 
 
537 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  33.86 
 
 
520 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  33.68 
 
 
587 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  35.43 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.99 
 
 
542 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.99 
 
 
542 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.59 
 
 
555 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.58 
 
 
554 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.4 
 
 
554 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.82 
 
 
554 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.4 
 
 
554 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  32.4 
 
 
554 aa  230  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.82 
 
 
554 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  32.82 
 
 
554 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.4 
 
 
554 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.34 
 
 
597 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.89 
 
 
568 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  34.4 
 
 
547 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.87 
 
 
622 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.67 
 
 
573 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.67 
 
 
573 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.23 
 
 
580 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.88 
 
 
618 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.89 
 
 
555 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.47 
 
 
605 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.23 
 
 
552 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  37.86 
 
 
547 aa  220  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.98 
 
 
569 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.3 
 
 
555 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  36.77 
 
 
570 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  36.77 
 
 
570 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.38 
 
 
615 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.08 
 
 
511 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  36.49 
 
 
565 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.55 
 
 
574 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.25 
 
 
569 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.4 
 
 
523 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  31.69 
 
 
537 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.88 
 
 
561 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  32.49 
 
 
564 aa  171  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  29.01 
 
 
555 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  30.94 
 
 
515 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.91 
 
 
529 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
570 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  32.49 
 
 
473 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  32.49 
 
 
473 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  32.49 
 
 
473 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.63 
 
 
543 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
569 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  29.9 
 
 
596 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  27.47 
 
 
502 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  27.66 
 
 
502 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  31.28 
 
 
474 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
569 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  30.08 
 
 
478 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  31.27 
 
 
502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  27.66 
 
 
502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
545 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  29.25 
 
 
501 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  28.68 
 
 
489 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  29.81 
 
 
488 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  30.38 
 
 
579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  27.75 
 
 
522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  28.54 
 
 
504 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
555 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  32.68 
 
 
506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
555 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  30.64 
 
 
498 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
550 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  26.76 
 
 
475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.85 
 
 
544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.85 
 
 
539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  29.27 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  29.27 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  27.92 
 
 
598 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  26.78 
 
 
564 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.22 
 
 
539 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.95 
 
 
545 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  28.95 
 
 
524 aa  113  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
584 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  26.93 
 
 
558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.2 
 
 
541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  26.42 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  28.33 
 
 
506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.82 
 
 
539 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
561 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
590 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  28.3 
 
 
503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>