More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4906 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 
511 aa  1023    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  60.61 
 
 
509 aa  569  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  54 
 
 
537 aa  482  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  47.17 
 
 
481 aa  336  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  39.22 
 
 
509 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.32 
 
 
507 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  33.72 
 
 
497 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.1 
 
 
503 aa  239  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.14 
 
 
552 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  34.33 
 
 
514 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.23 
 
 
580 aa  230  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.9 
 
 
542 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.9 
 
 
542 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  37.16 
 
 
547 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  32.63 
 
 
530 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  36.28 
 
 
565 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  32.95 
 
 
518 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  35.7 
 
 
547 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  39.6 
 
 
570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  39.6 
 
 
570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  33.59 
 
 
520 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  32.75 
 
 
525 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.32 
 
 
605 aa  209  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.86 
 
 
530 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.09 
 
 
568 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.09 
 
 
573 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.09 
 
 
573 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  30.33 
 
 
520 aa  202  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.54 
 
 
555 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  32.15 
 
 
503 aa  200  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.9 
 
 
555 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.65 
 
 
597 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.87 
 
 
569 aa  193  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.71 
 
 
554 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  26.71 
 
 
554 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.01 
 
 
554 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.9 
 
 
554 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.9 
 
 
554 aa  192  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.9 
 
 
554 aa  192  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  26.51 
 
 
554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.81 
 
 
569 aa  189  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.96 
 
 
555 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.51 
 
 
554 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  31.58 
 
 
587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  31.21 
 
 
564 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.99 
 
 
574 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.87 
 
 
561 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.44 
 
 
618 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.47 
 
 
523 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  36.49 
 
 
537 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.67 
 
 
622 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.94 
 
 
615 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2991  hypothetical protein  48.65 
 
 
228 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748678  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  28.85 
 
 
511 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  34.18 
 
 
501 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  29.8 
 
 
505 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
545 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  31.31 
 
 
511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
511 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  29.24 
 
 
511 aa  127  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  29.39 
 
 
550 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  28.78 
 
 
537 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
535 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  29.41 
 
 
585 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  29.01 
 
 
574 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  30.12 
 
 
546 aa  120  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  25.82 
 
 
544 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  29.13 
 
 
388 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  29.71 
 
 
548 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  29.11 
 
 
550 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  29.71 
 
 
548 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  24.88 
 
 
564 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  31.69 
 
 
493 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  28.15 
 
 
588 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  33.62 
 
 
497 aa  118  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
569 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  30.24 
 
 
461 aa  117  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  31.17 
 
 
478 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  31.03 
 
 
478 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  31.03 
 
 
478 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  29.29 
 
 
578 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  28.9 
 
 
571 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  29.92 
 
 
556 aa  117  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
555 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  29.05 
 
 
574 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
577 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  31.47 
 
 
486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  29.84 
 
 
518 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  23.54 
 
 
575 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  29.11 
 
 
555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 
572 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  25.4 
 
 
566 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  31.73 
 
 
475 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  29.55 
 
 
548 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
586 aa  114  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
581 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 
549 aa  114  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
570 aa  114  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
583 aa  114  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  27.2 
 
 
598 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>